科学家发现细菌稠浊会酿成基因相干出现偏差
发表在Science Advances上的一项新相干中,来自瑞典林雪平大学的相干团队标明,一种令东谈主混沌的细菌中常见DNA修饰在东谈主类或其他哺乳动物中并不存在。该相干标明,动物中表不雅遗传标记6mdA的检测可能是所用技能的局限性和样品的细菌稠浊酿成的。
几年前,一些关连相干的发表,引起了遗传学相干者的极大酷好。这些相干查抄了一个特别的表不雅遗传标记,即影响DNA序列在不同细胞中使用神气的DNA修饰。这个标记昔日从未在多细胞生物中不雅察到。比较之下,这种被称为“6mdA”的标记在细菌中较为常见,它在保护细菌免受病毒侵害方面弘扬着要紧作用。
许多相干团队的诠释称,他们在多种动物物种甚而东谈主类细胞中发现了6mdA,这不仅引起了相干界的极大酷好,也激励了一些问题。其中一个与检测到的6mdA水平关连,这个水平迥殊低,以至于科学家们怀疑这么一个荒僻的表不雅遗传信号是否竟然有作用。
在这些初步诠释之后,一些其他已发表的相干无法在动物中检测到6mdA。正如许多其他相干团队相同,林雪平大学生物医学和临床科学系相干员Colm Nestor博士团队也开动相干这种令东谈主混沌的表不雅遗传信号。可是,他们无法在东谈主体或小鼠细胞中检测到。最终,他们在两个东谈主体细胞样本中检测到了6mdA,但恶果发现两个样本王人被支原体细菌稠浊。
相干东谈主员怀疑表不雅遗传标记来自细菌而不是东谈主体细胞。他们用抗支原体的抗生素和谐细胞后,发现6mdA信号消散。
相干东谈主员合计,支原体稠浊是表不雅遗传学相干中被低估的问题。他们发现的支原体菌株在健康东谈主群中很常见,时时不会对健康酿成任何负面影响。由于支原体细菌不仅不错存在于细胞外,也不错存在于东谈主体细胞内,因此该细菌可能存在于东谈主类样品中,但未被检测到。对于大浩繁类型的细菌,相干东谈主员不错很容易地检测出实验室培养的细胞是否受到稠浊。可是,支原体稠浊的情况并非如斯,它需要特别的检测行动。
相干东谈主员很快发现,不仅支原体细菌给相干6mdA标记的相干东谈主员带来了问题。他们还发现了检测这种表不雅遗传修饰的几种行动的问题。
相干通信作家Nestor说:“咱们意志到,这些技能检测到的6mdA‘信号’仅仅杂音。可是,由于一些复杂的技能问题,其中一些行动中的布景噪声不是随即的,而是一个真正的信号。现时,咱们不错毫无疑问地说,哺乳动物中不存在6mdA。”
Nestor合计,哺乳动物中6mdA的相干诠释来自于在泰斗学术期刊上发表的实验讲求的相干。这瑕瑜常不寻常的,算作充足不同的东谈主工成品,有几种行动给出了访佛的误导性恶果。
Nestor说“当咱们分析迥殊荒僻的欢娱时,咱们必须要迥殊堤防,并议论咱们是否竟然不错用咱们遴荐的行动来测量它们。对于6mdA,若是相干东谈主员住手相干一些根柢不存在的东西,那就不错勤俭好多贵重的时候和财富,幸免更多的失望。”
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